Tantárgy adatlapja
| Tantárgy neve: | Proteomics P-ITMED-0029 |
|---|---|
| Tárgyfelelős: | Ligeti Balázs |
| Tantárgy oktatója: | Ligeti Balázs Rokobné Révész Ágnes Drahos László |
| A tantárgy céljának rövid ismertetése: | A kurzus célja a hallgatók megismertetése a proteomikai adatok jellegével és feldolgozásuk alapjaival. A hallgatók betekintést kapnak az adatok értelemezésének gyakorlati aspektusaiba is. |
| Elsajátítandó elméleti ismeretanyag: | Tömegspektrometriai módszerek: a spektrum információtartalma, detektorok típusai. Tandem MS és aktivációs eljárások. Peptidfragmentáció. Adatgyűjtési módszerek. Mintavétel, elválasztás, ionizáció a biomedicinális alkalmazásokban. Peptidek és fehérjék azonosítása, de novo szekvenálás és adatbázis keresés. Poszttranszlációs módosítások azonosítása. Kvantitatív proteomika. Adatfeldolgozás és statisztikai elemzés. Magas és alacsonyszintű eszközök gyakorlati alkalmazása. Fehérje-fehérje kölcsönhatások és MS/MS eredmények. Kapcsolódó területek: top-down eljárás, MALDI képalkotás, ionmbilitás-elválasztás stb. |
| Elsajátítandó gyakorlati ismeretanyag: |
|
| A 2-4 legfontosabb kötelező irodalom felsorolása bibliográfiai adatokkal (szerző, cím, kiadás adatai, (esetleg oldalak), ISBN): | Timothy D. Veenstra, John R. Yates III: Proteomics for biological discovery. Wiley, 2019. ISBN: 9781118279243. Daniela Cecconi (szerk.): Proteomics Data Analysis. Methods in Molecular Biology 2361,Springer 2021. ISBN: 978-1071616406. |
| A 2-4 legfontosabb ajánlott felsorolása bibliográfiai adatokkal (szerző, cím, kiadás adatai, (esetleg oldalak), ISBN): | Dr. Buday László, Dr. Nyitray László, Dr. Perczel András (szerk): Ezerarcú fehérjék, 12. fejezet Tömegspektrometria, 26. fejezet Proteomika Semmelweis Kiadó, (angol nyelvű kiadás folyamatban). ISBN: 9789633314586. Dr. Csősz Éva (szerk.): Bevezetés a proteomikába: a fehérjék korszerű vizsgálata. Semmelweis Kiadó, 2023. ISBN: 9789633315996. |
| Elmélet-gyakorlat aránya: | Elméleti óra óraszáma: 1 Gyakorlati óra és labor óra óraszáma: 0 + 1 |
| Az alkalmazott oktatási módszerek: |
|
| Az értékelés módja: | |
| Az értékelés kritériuma: | Előadás vetített pdf segítségével, gyakorlati demonstrációk, a Moodle felületen közzétett gyakorlati beadandó feladatok. A hallgatói aktivitás növelése érdekében a résztvevők választhatnak, hogy az órák közben felkínált Kahoot kvízek, projetkfeladat beküldése, vagy a félév végi vizsga révén szerzik meg a végső jegyet. |
| Miként járul hozzá a tantárgy a KKK-ban megjelölt kompetenciaelemek megszerzéséhez: | Bioinformatika mesterképzés: |
