A Szent II. János Pál Pápa Kutatóközpont vezetője Mons. Dr. Kuminetz Géza rektor, titkára pedig Ft. Dr. Ujházi Lóránd, a Kánonjogi Posztgraduális Intézet tanszékvezetője.
Teológiai Kutatóintézet:
Dr. Birher Nándor
kutatóintézet-vezető
- Biblikus Kutatócsoport
- Karitász Tanulmányok Kutatócsoport
- Keresztény Béke Kutatócsoport
- Teremtésvédelmi Kutatócsoport
- Valláspszichológiai Kutatócsoport
Keresztény Filozófiai Kutatóintézet:
Dr. Turgonyi Zoltán
kutatóintézet-vezető
- Bioteikai Kutatócsoport
- Joseph Ratzinger - XVI. Benedek Kutatócsoport
- Katolikus Misztika Kutatócsoport
- Keresztény Bölcseleti Kutatócsoport
- Szent Tamás Kutatócsoport
- Természet Könyve Kutatócsoport
Keresztény Társadalombölcselet Kutatóintézet:
Dr. Kuminetz Géza
kutatóintézet-vezető
- Állam és Egyház Kutatócsoport
- Keresztény Gazdaságtudományi Kutatócsoport
- Keresztény Régészeti és Történeti Kutatócsoport
- Paulus Hungarus Erkölcsteológiai Kutatócsoport
- Ut Unum Sint Ökumenikus Kutatócsoport
Teremtésvédelmi Kutatóintézet:
Ft. Dr. Ujházi Lóránd
kutatóintézet-vezető
