Tantárgy adatlapja
Tárgy neve: Számítógépes rendszerbiológia I.
Tárgy kódja: P-ITBIO-0015
Óraszám: N: 2/0/0, L: 0/0/0
Kreditérték: 2
Az oktatás nyelve: magyar
Követelmény típus: Kollokvium
Felelős kar: ITK
Felelős szervezeti egység: Pázmány Péter Katolikus Egyetem Információs Technológiai és Bionikai Kar
Tárgyfelelős oktató:
Dr. Csikász-Nagy Attila István
Tárgyleírás:
| Tantárgy neve: | Számítógépes rendszerbiológia I. P-ITBIO-0015 |
|---|---|
| Tárgyfelelős: | Csikász-Nagy Attila István |
| Tantárgy oktatója: | Csikász-Nagy Attila István |
| A tantárgy céljának rövid ismertetése: | A kurzus célja, hogy a hallgatók megismerjék a molekuláris hálózatok viselkedését és a rendszerbiológiai alapfogalmakat. Továbbá képesek legyenek a molekuláris hálózatok analízisére és biológiai rendszerek matematikai modelljeinek felállítására. |
| Elsajátítandó elméleti ismeretanyag: | A diákok elsajátíthatják a biológiai regulációs hálózatok modellezésének számításos módszereit. Megismerkednek különböző módszerekkel és azzal, hogy milyen biológiai kérdést milyen módszerrel lehet a legjobban modellezni. A kurzus bevezetést nyújt a számítógépes rendszerbiológia legfontosabb szoftvereinek alkalmazásába is. A kurzus fő témái:
|
| Elsajátítandó gyakorlati ismeretanyag: | n.r. |
| A 2-4 legfontosabb kötelező irodalom felsorolása bibliográfiai adatokkal (szerző, cím, kiadás adatai, (esetleg oldalak), ISBN): | E. Klipp, W. Liebermeister, C. Wierling, A. Kowald és R. Herwig, Systems Biology: A Textbook. Hoboken, NJ, USA: John Wiley & Sons, 2016. ISBN: 978-3-527-33636-4. U. Alon, An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits, 2. kiad. Boca Raton, FL, USA: Chapman and Hall/CRC, 2019. ISBN: 978-1-439-83717-7. |
| A 2-4 legfontosabb ajánlott felsorolása bibliográfiai adatokkal (szerző, cím, kiadás adatai, (esetleg oldalak), ISBN): | B. Ingalls, Mathematical Modeling in Systems Biology: An Introduction. Cambridge, MA, USA: MIT Press, 2013. ISBN: 978-0-262-01888-3. A. Csikász-Nagy, B. Kovács, G. Tóth, M. Varga és D. Horváth, „Agent based modeling of yeast colony growth reveals spatial control of cell-cycle progression,” Frontiers in Systems Biology, vol. 4, 2025. |
| Elmélet-gyakorlat aránya: | Elméleti óra óraszáma: 2 Gyakorlati óra és labor óra óraszáma: 0 + 0 |
| Az alkalmazott oktatási módszerek: | Frontális előadás, önálló témafeldolgozás. |
| Az értékelés módja: | Kollokvium |
| Az értékelés kritériuma: | A diákok az utolsó órán zárthelyi dolgozatot írnak, amely eredménye alapján megajánlott jegyet kaphatnak. Órai aktív részvétel alapján a zárthelyi dolgozat eredménye mellé plusszpontokat kaphatnak. |
| Miként járul hozzá a tantárgy a KKK-ban megjelölt kompetenciaelemek megszerzéséhez: | Molekuláris bionika mérnöki alapképzés: |
